Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms