Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GOLGA6L9A6NEM1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms