Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms