Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms