Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms