Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms