Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP3Q9Y6F1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms