Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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SNX13Q9Y5W8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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SNX13Q9Y5W8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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SNX13Q9Y5W8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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SNX13Q9Y5W8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SNX13Q9Y5W8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SNX13Q9Y5W8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SNX13Q9Y5W8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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