Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP11Q9Y3A2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms