Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms