Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms