Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms