Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms