Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms