Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms