Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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