Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms