Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF275Q9NSD4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms