Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms