Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms