Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 KCNJ10-204ENST00000637644 1239 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AL606490.5-201ENST00000413071 760 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC015878.2-201ENST00000584331 361 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AP003072.3-201ENST00000623456 594 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AL356273.1-201ENST00000441261 1152 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AP001099.1-201ENST00000579385 855 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms