Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms