Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms