Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms