Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms