Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms