Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms