Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms