Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms