Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLF1Q9BQI6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLF1Q9BQI6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLF1Q9BQI6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLF1Q9BQI6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLF1Q9BQI6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLF1Q9BQI6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLF1Q9BQI6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLF1Q9BQI6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLF1Q9BQI6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms