Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms