Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms