Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPA33Q99795 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms