Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms