Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms