Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms