Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms