Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms