Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRG4Q92954 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms