Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms