Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms