Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms