Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCD1Q6ZMY3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms