Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms