Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms