Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms