Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms