Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms