Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUPD1Q68J44 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUPD1Q68J44 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms