Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM236Q5W0B7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms